Ο Παναθηναϊκός γνωρίζει τους αντιπάλους του στη φάση του πρωταθλήματος της Conference League.
Οι πράσινοι θα αντιμετωπίσουν έξι ομάδες που θα δώσουν τρία εντός και τρία εκτός έδρας.
Στη φάση του πρωταθλήματος, μια ομάδα δεν μπορεί να παίξει εναντίον μιας ομάδας από την ίδια χώρα ή να αντιμετωπίσει περισσότερες από δύο ομάδες από την ίδια χώρα.
Οι οκτώ πρώτες ομάδες της μονής κατάταξης θα προκριθούν αυτόματα στη φάση των 16, ενώ οι ομάδες που βρίσκονται από την 9η έως την 24η θέση θα αγωνιστούν σε διπλούς αγώνες πλέι οφ νοκ άουτ για να εξασφαλίσουν μια θέση στη φάση των 16 της διοργάνωσης. Οι ομάδες που θα λάβουν θέση 25 έως 36 θα αποκλειστούν.
